مع شخصيات الليجو يعود (الجوكر) لمحاربة (باتمان) وفرقة العدالة، عبر عمل خطة مشتركة واتحاد بينه وبين (لكس لوثر) لتدمير مدينة (جوثام)، وعلى (سوبر مان) و(باتمان) وبقية فرقة العدالة إيقافهم بأى ثمن وإنقاذ (جوثام) من التدمير، وبالطبع، الأمر ليس بتلك البساطة، فعلى فريق الأبطال التصدي للعديد من المؤامرات والخطط الرهيبة من أجل إيقاف تدمير المدينة، خاصة مع محاولات (لوثر) لاكتساب قوى مختلفة لتدمير الفريق.
يحاول (باتمان) و(سوبرمان) وسائر أبطال رابطة العدالة أن يتصدوا لكافة المخططات الشريرة التي تحاك لـجوثام.