تتناول قصة الفيلم محاولة المنظمات الحكومية للتحكم في أنشطة الأبطال الخارقين والوقوف وجهًا لوجه ضد فريق المنتقمين، فيجد (كابتن أمريكا) نفسه في صراع مع حلفائه السابقين وعلى رأسهم (الرجل الحديدي) بهدف تقسيمهم وإضعافهم للسيطرة عليهم.
يقع صراع بين كابتن أمريكا والرجل الحديدي بعد سلسلة من التطورات غير المتوقعة والتي تقف ورائها منظمات حكومية.