يتعين على فريق سلاحف النينجا التصدي لعدو جديد، حيث يظهر ملك الفئران ليهدد بالسيطرة على المدينة بأكملها، ومن أجل تنفيذ خطته الشريرة يتحدى الجميع بقدرته على السيطرة على عقل المعلم سبلنتر.