تحاول منظمة ما السيطرة على عقول الشباب المصري وتزييف حقائق التاريخ المصري القديم. يأجر رجل من المنظمة رجالًا للعثور على يحيى ومرافقته في رحلة إلى العصور القديمة. يهدفون إلى تشويه حقيقة دور الملك بسماتيك الأول في تحرير البلاد من الاحتلال الأجنبي وتوحيدها.
يرفض يحيى عرضًا لتصوير فيديوهات عن حضارة مصر من إحدى القنوات الفضائية المجهولة. تمرض والدة يحيى، ويُخبر الطبيب أن الدواء مكلف للغاية. يقرر يحيى السفر للماضي لتصوير بعض اللقطات وقبول العرض لتوفير المال اللازم.
يكتشف يحيى أن صاحب القناة سبب مرض أمه، و يطلب منه السفر للعصور القديمة لتزييف بعض الحقائق مقابل مساعدته في شفاء والدته. يذهب يحيى للعصر القديم، ولكن لإيجاد حل للمشكلة، تظهر له نونية لمساعدته في رحلته.
يذهب يحيى وفضولي وكنوز والبروفيسور جميلة لزمن الملك باسمتيك الأول. يخطط يحيى لخداع فضولي ومساعدة والدته في الحصول على الدواء دون تزوير التاريخ.
يحكي سينو ليحيى نبوءة الملك باسمتيك الأول وكيف وحد البلاد. تخبر كنوز سينو بما حدث لأمها. يحاول عصام ومازن خداع حسان لأخذ حقنة دواء أم يحيى فيكشفهما.
ينصح يحيى الملك باسمتيك الأول بإرسال رسالة للحاكم الكوشي منتومحات لتحقيق السلام بين الجانبين. يحبس باسمتيك الأول فضولي وعتمان لكذبهما عليه، فيساومهما يحيى بخروجهما من السجن مقابل الدواء اللازم لأمه.
بأتي يحيى بالدواء لأمه وتتحسن حالتها. يعود للعصر القديم فيجد فضولي يدفن اللوحة المزيفة التي تزيف تاريخ الحضارة المصرية. يعثر عليهم جنود الملك بسماتيك الأول ويعتبرونهم خونة ويقررون إعدامهم.
يوقف الملك باسمتيك الأول إعدام يحيى ومن معه. يشرح له يحيى من أين أتوا وما سيحدث في حكمه والبلاد في المستقبل، فيعفو عنهم الملك. يُخبر الرجل الخفيّ فضولي بتعيين البروفيسور جميلة معه للقيام بالمهمة.
تبدأ البروفيسور جميلة العمل على مخططها لبناء آلة للعودة بالزمن دون الحاجة ليحيى. يطلب الملك رمسيس الثاني من نونيا مساعدة يحيى في مواجهة المنظمات التي تريد تزييف الهوية المصرية.
تُسلّم المنظمة السرية جهاز العودة بالزمن لجميلة وفضولي. يطلب يحيى من فهمي سبيد اختراق هاتف فضولي لمعرفة ما يحدث في المنظمة السرية، ويكتشفان أن البروفيسور جميلة تعمل مع المنظمة.
تطلب المنظمة من فضولي وجميلة العودة لمعركة عين جالوت لتغيير خريطة مدينة الفسطاط ووضع وثيقة مزيفة عن بيوت هدمتها حضارات أخرى. يعود يحيى للماضي ليمنع تلاعب فضولي وجميلة بالتاريخ، وتظهر نونيا لمساعدته.
تحكي نونيا ليحيى وكنوز قصة تولي السلطان المنصور حكم مصر، بدءًا من حرب الصالح أيوب ضد الصلبيين وصولاً لعزل قطز للمنصور عند وصول التتار قرب مصر وقتله رسل التتار.
تتفق جميلة مع قائد التتار على مساعدته في هزيمة جيش قطز مقابل أن تصبح حاكمة الفسطاط. ينصح يحيى قطز بالإرسال للمماليك البحرية لطمأنتهم. يطلب قائد التتار من فضولي تشغيل آلة الزمن ليصلوا للزمن الحالي.
ينصح يحيى قطز بعقد سلام مع الصلبيين لتجنب هجومهم عند المرور بعكا وتسهيل الوصول لجيش التتار. تتولى جميلة قيادة جيش التتار. تخبر نونيا يحيى بذلك فيذهب لمعسكر التتار لإفشال خططها.
يهجم قطز على جيش التتار في فلسطين. يعود كتبغا للعصر القديم فيحاول تجنب الخسارة كما في كتب التاريخ التي قرأها في العصر الحالي. يضع قطز فخًا لجيش التتار وينتصر عليهم.
تستغل جميلة شجار فهمي ويحيى فتطلب من فهمي الانضمام لها. يطلب الرجل الخفي من فضولي الإشراف على الفيلم المقرر تصويره لتزوير تاريخ مصر.
تدرب جميلة فهمي على مهمته القادمة. يستدعي رمسيس الثاني يحيى ليفهم مهتمة الجديدة ضد المنظمة السرية والمؤامرات التي تهدف لتشويه تاريخ الملكة كليوباترا.
تعود جميلة وفهمي للزمن القديم لإكمال مهمتهما. يواجه فهمي يحيى. تخبر جميلة الملكة كليوباترا بموت يوليوس قيصر لتفر من مصر حتى لا يقتلها الرومان.
يخدع سرحان وفهمي يحيى للإمساك به ليؤدوا مهمتهم دون مقاومته. تدون جميلة على جدران مصر أن أم الملكة كليوباترا من الحبشة. يُخبر الرجال كليوباترا بما تفعله جميلة والعصابة في الكهف فتأمر بإحضارهم.
تخدع جميلة كليوباترا وتخبرها أن يحيى زيف حقيقة أصولها. يواجه يحيى فهمي ثانيًة فيكتشف يحيى خلال المواجهة أن فهمي يرتدي قلادة تؤثر على مشاعره. يتصالح يحيى وفهمي بعد خلعه القلادة.
يطلب يحيى من سينو الرجوع بآلة الزمن للعصر الحالي ليسيطروا على جميلة والمنظمة. تسرد نونيا ليحيى وفهمي الصراعات في الدولة الرومانية وعزل يوليوس قيصر وزواج أنطونيوس بالملكة كليوباترا.
ترسل المنظمة نسخة طبق الأصل من يحيى لمنزله للحصول على آلة الزمن التي وصل بها سينو. يحذر يحيى كليوباترا من جميلة وتزوير هويتها. يخدر شبيه يحيى سينو ليخطفه.
تأمر كليوباترا بحبس جميلة وحسان لتزويرهما أصولها. يطلب يحيى من كليوباترا أخذ جميلة وحسان معه للعصر الحالي حتى لا يشكلوا خطرًا على الزمن القديم. يعود يحيى للعصر الحالي فيرسل له فضولي فيديو لخطف سينو.
تساوم جميلة يحيى بجلب قطعة آثرية من زمن الإسكندر الأكبر للإفراج عن سينو. يوافق يحيى ويخدعها بإعطائها سيفًا مزيفًا. تكتشف جميلة الخدعة وتواصل رحلتها في زمن الإسكندر الأكبر بمفردها.
تطلب جميلة من عتمان التنكر كأحد خدم الإسكندر الأكبر لسرقة سيفه. يقبض على عتمان ويأمر الإسكندر بحبسه وجميلة. يخرجهما شخص مجهول من السجن. يفشل أبو يحيى وكنوز في إنقاذ سينو من المنظمة.
يتبيّن أن الكاهن مريبتاح أخرج جميلة وعتمان من السجن، ويتعاون معهما للتخلص من يحيى. يشجع يحيى الإسكندر على بناء الإسكندرية. يشتبك مرتزقة مريبتاح ورجال الإسكندر عند شاطئ البحر. يعود يحيى للزمن الحالي.
تقرر جميلة قتل سينو انتقامًا من يحيى. يتراجع فضولي عن العمل مع المنظمة وينقذ سينو ويذهب به لمنزل يحيى. تطلب المنظمة من جميلة الرجوع للعصر القديم للتدخل في منسوب مياه نهر النيل.
تساعد جميلة والروبوت عتمان وحسان في خطتهما لتقليل منسوب مياه النيل لجفاف الأرض. يحاولون إنجاح المهمة في أزمنة مختلفة. يفيق يحيى من غيبوبته ويبين له أستاذ عصام خطة جميلة ومعاونيها ليوقفهم.
ينتقل يحيى وسينو لعصر الاضمحلال وينتقل عصام وكنوز ونونيا لعصر المستنصر بالله ليفشلوا مخطط جميلة في تقليل منسوب المياه. تقبض الملكة إياح حتب على جميلة. ينتقل يحيى لعصر المستنصر بالله لكن بعد حلول المجاعة بمصر.
يشرح يحيى للوزير بدر الجمالي حل المجاعة في مصر. يعود يحيى للزمن الحالي ويسلم آلة الزمن لوكالة الفضاء المصرية، ويعمل على إنشاء متحف للأحداث التي مر بها ليستفيد العالم من تجاربه.